冷库水源选择范围很广，根据用水对象、给水方式和取水可行性决定，同时常还需结合当地气象、水文、地址等因素进行详细比较才能确定。冷库用水量因库而异，主要与冷类型及用途相关，如压缩机、冷凝器的冷却用水、水产品加工等鱼虾清洗、肉类屠宰、制冰用水及生活、消防用水等。因此，冷库水源的选择很重要，这将直接关系到制冷系统的制冷效率、维护保养费用及冷库使用寿命。
冷库水源选择：城市自来水
城市自来水是目前冷库系统中用的最多的一种，符合冷库、空调用水对水质、水温、水量等的要求。优点是可以直接使用且基建投资很少，但大量使用需要得到自来水主管部门的允许，而且水价较高费用大。
冷库水源选择： 地面水
地面水指江河水，湖泊、水库蓄水及海水等，具有水量较大、取水费用较低、矿化度和硬度较低等优点。但是，受地面多种因素的影响，地面水易受环境污染，浑浊度和细菌含量高，水温变化幅度大等。因此，地面水必须经过净水设备处理后才能使用。
冷库水源选择：地下水
地下水常指深井水或浅井水，主要来源于大气降水和地面水的渗入，因此具有水源较清，不易受污染，细菌含量少，水温较低且常年恒定，取水费用低等优点。 但由于打井和取水设备价格较贵，故它的初次投资较贵，且水中无机盐的浓度较高，应进行软化处理后使用(水质和水量也是因地而异)。
